Souvent considéré comme le village plus suggestif, Vernazza a été cité pour la première fois dans un document en 1080.

On peut déduire de la structure architecturale de ce bourg, (et de la présence d’un certain nombres d’éléments précieux dans les constructions) qu’il était déjà florissant au Moyen-Age: loggias, églises, maisons-tour et porches. Les vestiges d’un « castrum », série de fortifications médiévales du XIème siècle comprenant un château et une tour cylindrique, dominent le village de Vernazza. Les maisons sont séparées par une seule rue centrale, et, perpendiculairement, par de raides escaliers nommés « arpaie ».

Le monument historique principal est l’église Ste Marguerite d’Antioche, en style roman-génois, daté du XIIIème siècle; on peut en reconnaître la partie médiévale, et celle datant de la renaissance.

Nostra Signora di Reggio (Notre Dame de Reggio) est le sanctuaire de Vernazza; on y accède par un sentier s’achevant sur une sorte de plat ombragé, où jaillit une source. L’édifice, cité dans les textes à partir de 1248, époque à laquelle il fut dédié à la Vierge Marie, est immergé dans un coin de nature encore intact, à trois cents mètres d’altitude, s’ouvrant sur un point de vue extraordinaire. L’église de Reggio est en fait très ancienne; elle fut construite au XIème siècle, probablement sur les ruines d’un précédent édifice, dont les traces sont encore visibles dans la crypte située sous le plancher. On y vénère une représentation de la « Madonna Nera » (Vierge Noire à l’enfant, dite « l’africaine »), dont les vertus miraculeuses furent certifiées en 1771 par un décret, suite aux nombreux présumés prodiges qui avaient fait de ce sanctuaire le but de nombreux pèlerinages depuis le XVIIème siècle.